كلية الإدارة والاقتصاد في جامعة الفلوجة تأسست في عام 1998، وكانت في بدايتها تابعة لجامعة الأنبار، ثم أصبحت النواة الأساسية لتأسيس جامعة الفلوجة. عند تأسيسها، ضمت الكلية قسمين أكاديميين فقط: قسم الإدارة العامة وقسم الاقتصاد. يمنح القسم الأول شهادة البكالوريوس في الإدارة العامة، بينما يمنح القسم الثاني شهادة البكالوريوس في الاقتصاد.
في العام الدراسي 2013-2014 تم تأسيس جامعة الفلوجة، وأصبحت الكلية إحدى كلياتها. ومن أجل تلبية متطلبات سوق العمل، ورغم محدودية الموارد، تم تأسيس قسم العلوم المالية والمصرفية، تلاه قسم إدارة الأعمال. وبهذا أصبحت الكلية تضم أربعة أقسام أكاديمية حسب تسلسل تأسيسها كالتالي:
- قسم الإدارة العامة
- قسم الاقتصاد
- قسم العلوم المالية والمصرفية
- قسم إدارة الأعمال
أما الدراسة المسائية، فهي تشمل أيضاً الأقسام الأربعة: الاقتصاد، الإدارة العامة، العلوم المالية والمصرفية، وإدارة الأعمال. وقد شهد عدد الطلبة ازديادًا مستمرًا على مر السنين، وخرّجت الكلية العديد من الدفعات الحاصلة على شهادة البكالوريوس في تخصصات مختلفة.
وفيما يتعلق بالدراسات العليا، فقد تم افتتاح برنامج الماجستير في الاقتصاد عام 2002، تلاه برنامج الدكتوراه في الاقتصاد عام 2018. وفي عام 2022 تم استحداث دبلوم في التخطيط الأمني الاستراتيجي، وفي عام 2023 تم إطلاق برنامج ماجستير في الإدارة العامة.
ونظرًا للزيادة المستمرة في أعداد الطلبة وتأسيس أقسام أكاديمية جديدة لتلبية متطلبات سوق العمل، تخطط الكلية للإسراع في بناء مبانٍ جديدة داخل الحرم الجامعي. وستشمل هذه المرافق الجديدة قاعات دراسية إضافية، ومكتبة حديثة، وكافتيريا، بهدف توفير بيئة مناسبة للطلبة في الكلية.